Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD47Q08722 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD47Q08722 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms