Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD51Q06609 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAD51Q06609 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms