Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms