Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCQ00610 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCQ00610 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms