Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERVK_113P62684 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms