Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB8AP61006 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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