Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms