Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERFP50548 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERFP50548 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ERFP50548 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms