Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FLT4P35916 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FLT4P35916 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLT4P35916 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLT4P35916 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms