Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTPDP35247 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms