Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB5P28074 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms