Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APCP25054 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APCP25054 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms