Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HOXA5P20719 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA5P20719 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms