Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTLA4P16410 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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