Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVV-2B6SEH9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms