Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PALD1Q9ULE6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PALD1Q9ULE6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms