Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTNNA3Q9UI47 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms