Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms