Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EYA3Q99504 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms