Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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