Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms