Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPPQ6IPU0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms