Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAVIN4Q5BKX8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAVIN4Q5BKX8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms