Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GEN1Q17RS7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GEN1Q17RS7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GEN1Q17RS7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GEN1Q17RS7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GEN1Q17RS7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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GEN1Q17RS7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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