Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYPL1Q16563 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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