Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTTNQ14247 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms