Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN3Q13286 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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