Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms