Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CALD1Q05682 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CALD1Q05682 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms