Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB1P82279 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB1P82279 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB1P82279 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms