Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms