Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB1AP62820 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB1AP62820 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1AP62820 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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