Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPS4XP62701 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPS4XP62701 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPS4XP62701 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms