Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCC1P33527 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms