Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC9P31274 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms