Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNTFRP26992 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms