Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTPS1P17812 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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