Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT3P12035 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT3P12035 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT3P12035 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT3P12035 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT3P12035 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRT3P12035 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRT3P12035 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT3P12035 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT3P12035 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT3P12035 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT3P12035 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT3P12035 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT3P12035 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT3P12035 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KRT3P12035 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms