Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIPP01282 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIPP01282 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms