Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SERPINA1P01009 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERPINA1P01009 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms