Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F3O00716 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms