Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf172C9J069 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf172C9J069 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf172C9J069 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf172C9J069 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf172C9J069 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf172C9J069 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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C9orf172C9J069 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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C9orf172C9J069 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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