Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MBD2Q9UBB5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms