Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB9Q9NP78 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ABCB9Q9NP78 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ABCB9Q9NP78 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms