Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF145Q96MT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF145Q96MT1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF145Q96MT1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms