Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL29Q96CT2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL29Q96CT2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL29Q96CT2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms