Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMYD1Q8NB12 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD1Q8NB12 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMYD1Q8NB12 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD1Q8NB12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms