Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CARM1Q86X55 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARM1Q86X55 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARM1Q86X55 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms