Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 MFSD9-201ENST00000258436 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 58
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PRPF8Q6P2Q9 NTPCR-207ENST00000494689 767 ntTSL 211.42□□□□□ -0.583e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 TRAPPC6B-205ENST00000555269 1000 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.743e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 BUB3-204ENST00000407911 895 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.743e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 OXNAD1-203ENST00000442255 1994 ntTSL 510.22□□□□□ -0.773e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-15■■■■■ 56.9
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PRPF8Q6P2Q9 OXNAD1-209ENST00000627468 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.943e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 LGALS3-207ENST00000556438 1734 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.963e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 NTPCR-206ENST00000490807 980 ntTSL 28.83□□□□□ -13e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 NTPCR-203ENST00000479125 761 ntTSL 38.83□□□□□ -13e-15■■■■■ 56.9
PRPF8Q6P2Q9 POLR3G-201ENST00000399107 3285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -13e-15■■■■■ 56.9
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