Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPPQ6IPU0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPPQ6IPU0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPPQ6IPU0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms